17 марта 2022 года Митрополит Виленский и Литовский Иннокентий обратился к своей пастве с посланием, в котором категорично заявил, что «Литва — это не Россия«, а Литовская Православная Церковь решительно осуждает российскую агрессию против Украины. Кроме того, он заявил о несовпадении политических взглядов литовских православных с Патриархом Кириллом.
Данное заявление стало результатом обсуждений на епархиальном собрании духовенства, где среди священства высказывались критические замечания по поводу поддержки Патриархом Кириллом российской агрессии против Украины, что приводит к падению доверия к Московскому Патриарху среди литовских православных верующих, ставит перед ними моральную дилемму и препятствует дальнейшему участию в богослужебной жизни Православной цекрви в Литве.
Белорусский священник Александр Шрамко, политический эмигрант в Литве, в своем анализе решений, принятых на последнем заседании Синода РПЦ, отмечал курс на усиление контроля за епархиями в «ближнем зарубежье».
14 апреля Митрополит Иннокентий попытался отмежеваться от наиболее инициативных священников своей епархии, которые поддержали заявленную им самим позицию по поводу российской агрессии против Украины, и отстранил от должности многолетнего канцлера Православной церкви Литвы протоиерея Виталиуса Моцкуса, сняв его также с настоятельства в Пречистенском кафедральном соборе, с должности благочинного Виленюсского благочиния, поставив на его место викарного епископа Трокайского Амвросия (Федуковича). Он также отправил за штат двух священников — иерея Виталиуса Даупараса и иерея Гинтараса Сунгайлу.
Символически, это произошло в Великий четверг по западному календарю.