Пастор Юрий Сипко, с 2002 по 2010 годы являлся председателем Российского союза евангельских христиан-баптистов, бывший вице-президент Всемирного баптистского альянса.
С начала российской агрессии против Украины последовательно выступал против войны в проповедях, заявлениях, интервью и социальных сетях. С 2014 года выступал против аннексии Крыма.
8 августа 2023 года стало известно, что Московское управление СК РФ возбудило против него уголовное дело по п. «д» ч. 2 ст. 207.3 УК РФ (публичное распространение заведомо ложной информации об использовании Вооруженных сил Российской Федерации — по мотивам политической, идеологической, расовой, национальной или религиозной ненависти). Ему вменяется публикация в марте 2022 года «видеоролика для неограниченного круга лиц», в котором, якобы «согласно психолого-лингвистическому исследованию, содержится заведомо ложная информация» о действиях российской армии в Украине.
Были проведены обыски в доме и в церкви у Сипко, а также у его соратников. Сам пастор, узнав о возбужденном против него деле, успел покинуть Россию. Силовики при обыске застали сына пастора, которого задержали и допросили в Следственном комитете в качестве свидетеля. Стало также известно, что обыск прошел у пастора Альберта Раткина в Калуге, пастор также был задержан и допрошен, и в данный момент находится в статусе свидетеля по делу. Раткина отпустили из управления ФСБ, но взяли подписку о неразглашении. Альберт Раткин предоставлял для Юрия Сипко площадку на своем ютуб-канале «Взгляд с Небесной».
Во время задержания епископа Альберта Раткина и обыска на квартире у пастора Юрия Сипко сотрудники Следственного комитета сняли и опубликовали видеоролик, где для дискредитации их антифашистской позиции при обыске с нарочитой фиксацией внимания был показан «заблюренный» портрет Гитлера на рабочем столе, который в реальности является антифашистским материалом — изданием на ДВД-дисках известного документального сериала BBC «Секреты Рейха. Тайны нацизма».
Федеральные телеканалы, в частности, «Первый» и «НТВ» показали в связи с возбуждением дела и обысками сюжеты, в которых использовались такие высказывания о протестантских общинах (баптистов, пятидесятников) как «псевдорелигиозные» или «радикальные религиозные» организации, «центры влияния, спонсируемые иностранными спецслужбами», «американский культ», «экстремистские секты». Данные высказывания содержат признаки языка ненависти и направлены на дискредитацию религиозных общин.
Пастор был объявлен в розыск.