Изначально ее обвиняли по ч. 1 ст. 284.1 УК (участие в деятельности иностранной или международной неправительственной организации, в отношении которой принято решение о признании нежелательной на РФ ее деятельности). Но затем обвинение было изменено на более тяжелую ч. 3 ст. 284.1 УК (организация деятельности нежелательной организации).

Правозащитники полагают, что Щеткину преследуют за сотрудничество с одной из организаций «Фалуньгун», деятельность которых признана в России нежелательной. В Китае с 1999 года деятельность движения Фалуньгун полностью запрещена и уголовно наказуема. Есть мнение, что власти в России преследуют их, чтобы «сделать приятное Китаю».